结构方程模型：R语言入门→SEM原理→lavaan全局估计→piecewiseSEM局域估计→blavaan/brms贝叶斯SEM

本次内容利用开源软件R平台以生态学领域研究问题为主线如生物多样性、物种分布、生物入侵、生物地理格局、生物多样性与生态系统功能BEF、生态恢复、气候变化对物种分布影响等通过理论和实际操作相结合的方式由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程使学者能够利用结构方程模型方法解决实际研究和工作中遇到的相关科学问题。包括R语言入门、结构方程模型原理介绍、结构方程模型分析入门及高阶应用、潜变量分析、复合变量分析及贝叶斯结构方程模型参数估计。利用lavaanpiecewiseSEMblavaan及brms程序包分别从全局估计、局域估计及相应贝叶斯估计方法实现结构方程模型分析。既适合R语言和结构方程模型的初学者也适合对结构方程模型有高阶应用需求的研究生和科研人员。专题一 R/Rstudio简介及入门①R及Rstudio介绍背景、软件及程序包安装、基本设置等②R语言基本操作包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等③R语言数据文件读取、整理清洗、结果存储等含tidverse④R语言基础绘图含ggplot基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储专题二 结构方程模型SEM介绍①SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾②SEM的基本结构③SEM的估计方法④SEM的路径规则⑤SEM路径参数的含义⑥SEM分析样本量及模型可识别规则⑦SEM构建基本流程专题三 R语言SEM分析入门lavaan VS piecewiseSEM①结构方程模型在生态学研究中的应用介绍及模型要点回顾②结构方模型估计方法局域估计和全局估计的基本工作原理、主要区别及应用情景分析③案例群落物种丰富度恢复的直接及间接效应direct and indirect effectsSEM分析基本流程-lavaan vs piecwiseSEM●模型建立●模型拟合●模型评估●结果展示练习1根据元模型meta-model构建模型练习2火烧干扰后植物群落恢复直接、间接及调节效应分析专题四 SEM全局估计lavaan在生态学领域高阶应用案例1湿地生态系统初级生产力的直接和间接效应分析①问题提出、元模型构建②模型构建及模型估计③模型评估路径增加和删减原则、最优模型筛选方法④结果表达案例2火烧干扰后植物群落恢复效果评估-数据缺失和正态性不足数据处理案例3放牧对海拔与生物量关系的影响分析-数据分组分析案例4农业用地比例对河口水草多度影响-数据分层/嵌套分析练习环境异质性和资源可获得性对不同演替阶段林下维管植物多样性的影响专题五 SEM潜变量分析在生态学领域应用①潜变量的定义、优势及应用背景分析②潜变量分析实现基本原理③案例1海岸带米草群落生态恢复表现评估-单潜变量模型构建④案例2城市景观中土地利用对有花植物资源和访花昆虫的直接与间接影响-多个潜变量模型构建练习植物多样性、能量梯度及环境梯度对动物多样性格局的影响-构建动物多样性潜变量专题六 SEM复合变量分析在生态学领域应用①复合变量的定义及在生态学领域应用情景分析②复合变量分析实现途径③案例1生态力与生物多样性形成机制分析-土壤理化因子的多复合变量构建④案例2火烧后植被恢复对物种丰富度影响-复合变量解决非线性问题⑤案例3气候暖化、海平面上升对湿地植物群落的复合影响-复合变量解决交互作用问题练习植物群落物种多样性是否会提高其对入侵植物的抵抗力-多复合变量实现专题七 局域估计SEM -piecewiseSEM及生态学领域高阶应用①piecewiseSEM对内生变量为二项及泊松分布数据的分析②混合效应模型时间自相关问题气候波动对海草床生态系统食物网结构影响③空间自相关问题NDVI空间变化与气候和多样性关系④系统发育相关问题物种属性、社会性进化特征对海虾领域范围和多度影响-⑤分组数据、交互作用、非线性关系问题分析实例数据同专题四和六练习人类活动、环境条件、物种属性对动物领域大小相对贡献-分组分析和分类变量处理专题八 贝叶斯SEM在生态学领域应用①贝叶斯bayes方法简介②R语言贝叶斯SEM实现程序包blavaan和brms介绍③案例1气候及生态位重叠程度对田鼠物种丰富度影响模型比较、直接和间接效应计算blavaan④案例2火烧后对植被恢复影响因素-模型拟合、模型比较和评估brms练习生物地理历史因素对北半球森林的初级生产力的影响brms推荐基于R语言piecewiseSEM结构方程模型在生态环境领域实践技术应用结构方程模型Sructural Equation ModelingSEM可分析系统内变量间的相互关系并通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网具有强大的数据分析功能和广泛的适用性是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。在R语言结构方程程序包中piecewiseSEM语法简洁将结构方程模型拆分为多个组分component模型进行拟合和评估可与混合效应模型实现无缝对接在应对研究系统中复杂数据结构和类型如多层数据嵌套和非正态分布类型变量二项分布、泊松分布有明显的优势。因而在生态环境领域得到广泛应用是该领域颇受欢迎的结构方程模型程序包。本内容基于R语言piecewiseSEM程序包通过理论和实际操作相结合的方式由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程。我们筛选大量经典案例这些案例来主流期刊具有很大的参考和借鉴价值。训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、piecewise包简介及应用案例、非正态分布变量分析、嵌套/分层/多水平数据分析、重复测量和时间数据分析、空间自相关数据分析、系统发育数据分析、复合变量分析、分类变量、非线性数据及数据分组分析。推荐最新基于R语言lavaan结构方程模型SEM实践技术应用结构方程模型Sructural Equation ModelingSEM是分析系统内变量间的相互关系的利器可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网具有强大的数据分析功能和广泛的适用性是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。在R语言结构方程程序包中lavaan具有简洁的语法结构、成熟模型构建和调整过程和稳定可靠的结果等特点使其不亚于收费商业软件是最受欢迎的结构方程模型程序包之一。本内容基于R语言lavaan程序包通过理论和实际操作相结合的方式由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程。我们筛选大量经典案例这些案例来自Nature、Ecology、Ecological Applications、Journal of Ecology、Oikos及Ecography等主流期刊具有很大的参考和借鉴价值。训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。感谢点赞关注→【科研充电吧】全 网 同 名